Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKDCCQ504Y2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms