Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms