Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HFEQ30201 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HFEQ30201 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HFEQ30201 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms