Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEACAM16Q2WEN9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms