Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPHKAPQ2M3C7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPHKAPQ2M3C7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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