Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ISXQ2M1V0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms