Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GEN1Q17RS7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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