Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms