Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTN1Q16799 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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RTN1Q16799 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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RTN1Q16799 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTN1Q16799 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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