Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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