Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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SSX1Q16384 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SSX1Q16384 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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