Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VPS72Q15906 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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