Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA2Q15822 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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