Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTPAQ15257 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms