Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK1Q15118 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms