Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK5R1Q15078 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK5R1Q15078 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms