Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms