Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMCO1Q147U7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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