Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNB1Q14721 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNB1Q14721 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms