Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCARF1Q14162 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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