Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE4AQ14139 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms