Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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