Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2H2Q13888 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms