Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLF9Q13886 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms