Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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ITGA9Q13797 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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ITGA9Q13797 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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ITGA9Q13797 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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ITGA9Q13797 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA9Q13797 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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