Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH18Q13634 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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