Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LSAMPQ13449 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LSAMPQ13449 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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