Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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