Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SEMA3BQ13214 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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