Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CALCOCO2Q13137 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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