Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RLFQ13129 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RLFQ13129 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RLFQ13129 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RLFQ13129 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RLFQ13129 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RLFQ13129 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RLFQ13129 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RLFQ13129 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RLFQ13129 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RLFQ13129 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RLFQ13129 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RLFQ13129 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RLFQ13129 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RLFQ13129 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RLFQ13129 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms