Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms