Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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