Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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