Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGNL1Q0VF96 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms