Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMAGPQ0VAQ4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMAGPQ0VAQ4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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