Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms