Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE4CQ08493 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms