Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GOLGA3Q08378 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms