Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms