Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TNP2Q05952 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms