Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CD164Q04900 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms