Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC25A11Q02978 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms