Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4A11Q02928 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4A11Q02928 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms