Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CENPEQ02224 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms