Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
OTUD4Q01804 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms