Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TFAMQ00059 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms