Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK11-1P61568 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms