Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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