Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CABP4P57796 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CABP4P57796 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CABP4P57796 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABP4P57796 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABP4P57796 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABP4P57796 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABP4P57796 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABP4P57796 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABP4P57796 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CABP4P57796 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CABP4P57796 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CABP4P57796 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CABP4P57796 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CABP4P57796 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms